При медицинском факультете в 1921 г. было организовано научное медицинское Общество, в котором кроме сотрудников факультета, принимали участие практические врачи города и области. В 1922 г. создано Студенческое научное общество имени И.И. Мечникова под руководством профессоров А.А. Мелких, В.Г. Шипачёва и О.И. Бронштейна. С 1923 г. стал издаваться «Иркутский медицинский журнал».

        В 1930 г. Народный комиссариат просвещения (Наркомпрос) передал в ведение Народного комиссариата здравоохранения (Наркомздрава) все медицинские отделения и факультеты, в связи с этим Иркутский государственный медицинский институт приобрел самостоятельный юридический статус. В 1992 г. Иркутский государственный медицинский институт прошёл государственную аттестацию по оценке качества подготовки специалистов, проведённую государственной инспекцией по аттестации учебных заведений Госкомитета РФ по высшему образованию. По заключению учебно-методического объединения по медицинскому образованию в институте реализуется университетский принцип образования. Таким образом, весь комплекс качеств и характеристик сделал возможным переход медицинского института (в мае 1995 г.) на новый статус – «университет».

     В 1997, 2002, 2007 и 2012 гг. ИГМУ проходил очередные комплексные оценки деятельности, аттестацию и государственную аккредитацию. В результате последней из них ИГМУ был подтверждён статус университета (свидетельство о государственной аккредитации серия 90АО1 №0000001 рег. №0001 от 25.06.2012 г. выдано Федеральной службой по надзору в сфере образования и науки). Федеральной службой по надзору в сфере образования и науки выдана лицензия на право ведения образовательной деятельности в сфере высшего профессионального образования серия 90ЛО1 №000500 рег. №0462 от 14.12.2012 г.

       Согласно распоряжению Правительства Российской Федерации от 23.03.2010 №395-р университет реорганизован путем присоединения к нему федерального государственного учреждения среднего профессионального образования «Иркутское медицинское училище (техникум)», с последующим  образованием на основе присоединенного обособленного структурного подразделенияИнститут сестринского образования